Efecto del Disolvente en la Conformación Estructural de la Glibenclamida

Abstract

Los farmacos empleados para tratar la diabetes tipo 2 presentan limitaciones y efectos adversos. Esto conlleva a la necesidad de continuar con la búsqueda denuevas moléculas para di señar alternati vas terapéuti cas paresta enfermedad. El desarrollo de un nuevo fármaco es un proceso costoso y largo, del cual sólo una molécula de miles tiende a ser aprobada para su comercialización. Una estrategia que permi taldi smi nuci ón de costos y tiempas el diseño de fármacos asisti do por computadora. Una herramienta computaci onal que onsi dera el dinami smo delas enzimas, así como su interacción con otras moléculas en di solvente acuosa es la dinámi ca molecular Es impartante la preparaci ón previa de los ligandos a si mular por esta técnica para reali zar cálculos más preci sos un paso para preparar los li gandos es la opti mi zaci 6n de su estructura y consi derar el efecto del solvente sobre estos Por esta razón, en el presente trabajo se ha planteado anali zar in silico el comportami ento e interacci ones ntramoleculares de la gli benclami den di solvente acuosa Para ello, se reali zoun análi si s conformaci onal teóri co empleandias herrami entasxtb y CREST para muestrear las di ferentes conformaci ones que se pueden generar en di solvente acuoso y fase gas para la gli benclami da. Losdatos obteni dos sugieren queeste fármaco podría presentar dos potenci ales conformaci ones en forma de S y U, cuando se encuentra en disolvente acuosa, mi entra que en fase gas solo la conformaci ón en forma de U prevalece. Estas predi eci onessugi eren que, es i mportante consi derar una previa optimización estructuralantes de generar la parametrización del ligando y en el casoparticular de la gli benclami da es i mportante consi deranmbas conformaci ones con el fin de mejorar la parametri zaci ón del ligando antes de ser someti do a di námi ca molecular.