1. These authors contributed equally
2. Centre International de recherche en infectiologie (CIRI), Virpath Team, Inserm U1111, CNRS UMR5308, École Normale Supérieure de Lyon, UCBL, Université de Lyon, Lyon, France
3. CNR des virus des infections respiratoires (dont la Grippe), Institut des Agents Infectieux, Hopital de la Croix Rousse, HCL, Lyon, France
4. Mathematical Modelling of Infectious Diseases Unit, Institut Pasteur, UMR 2000, CNRS, Paris, France
5. Santé Publique France, Direction des maladies infectieuses, Saint-Maurice, France
6. CNR des virus des infections respiratoires (dont la Grippe), Molecular Genetics of RNA Viruses, CNRS UMR 3569, Institut Pasteur, Université de Paris, Paris, France
7. GHU Pitié-Salpêtrière APHP, 83, boulevard de l’hôpital & SU-INSERM UMR_S 1136 Team 3 THERAVIR IPLESP, Paris, France
8. Infection Antimicrobials Modelling Evolution, UMR 1137, INSERM, Université de Paris, Paris, France
9. Centre for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB), Collège de France, CNRS, INSERM, PSL Research University, Paris, France
10. These senior authors contributed equally