1. CIRI, Centre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, Lyon, France
2. Joint Research Unit Civils Hospices of Lyon-bioMérieux, Civils Hospices of Lyon, Lyon Sud Hospital, Pierre-Bénite, France
3. Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France
4. GenEPII sequencing platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France
5. Mirialis - Biogroup Auvergne Rhône alpes, Cluses, France
6. Dyomédéa-BIOGROUP – Plateau technique de la Sauvegarde, Lyon, France
7. Infectious and Tropical Diseases Unit, Hospices Civil de Lyon, Lyon, France
8. Team GIMAP, CIRI—Centre International de Recherche en Infectiologie, Université Jean Monnet de Saint-Etienne, Université Claude Bernard Lyon 1, Inserm, U1111, CNRS, Saint-Etienne, France
9. Laboratoire des Agents Infectieux, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Étienne, Saint-Etienne, France