Dynamics of viral shedding during ancestral or Omicron BA.1 SARS-CoV-2 infection and enhancement of pre-existing immunity during breakthrough infections

Author:

Saade Carla12ORCID,Brengel-Pesce Karen2,Gaymard Alexandre13,Trabaud Mary-Anne3ORCID,Destras Gregory134,Oriol Guy2,Cheynet Valérie2,Debombourg Marion2,Mokdad Bouchra2,Billaud Geneviève3,Oblette Antoine34,Créhalet Hervé5,Giannoli Jean-Marc6,Garrigou Christine3,Generenaz Laurence2,Compagnon Christelle2,Boibieux André7,Lina Bruno134ORCID,Morfin Florence134ORCID,Pozzetto Bruno89,Josset Laurence134ORCID,Trouillet Assant Sophie123ORCID,Bal Antonin134ORCID

Affiliation:

1. CIRI, Centre International de Recherche en Infectiologie, Team VirPath, Univ Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, Lyon, France

2. Joint Research Unit Civils Hospices of Lyon-bioMérieux, Civils Hospices of Lyon, Lyon Sud Hospital, Pierre-Bénite, France

3. Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Laboratoire associé au Centre National de Référence des virus des infections respiratoires, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France

4. GenEPII sequencing platform, Institut des Agents Infectieux, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France

5. Mirialis - Biogroup Auvergne Rhône alpes, Cluses, France

6. Dyomédéa-BIOGROUP – Plateau technique de la Sauvegarde, Lyon, France

7. Infectious and Tropical Diseases Unit, Hospices Civil de Lyon, Lyon, France

8. Team GIMAP, CIRI—Centre International de Recherche en Infectiologie, Université Jean Monnet de Saint-Etienne, Université Claude Bernard Lyon 1, Inserm, U1111, CNRS, Saint-Etienne, France

9. Laboratoire des Agents Infectieux, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Étienne, Saint-Etienne, France

Funder

Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales

Publisher

Informa UK Limited

Subject

Virology,Infectious Diseases,Drug Discovery,General Medicine,Immunology,Microbiology,Parasitology,Epidemiology

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